Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

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Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
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