Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms