Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc87Q8CDL9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc87Q8CDL9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc87Q8CDL9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc87Q8CDL9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc87Q8CDL9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc87Q8CDL9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc87Q8CDL9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc87Q8CDL9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc87Q8CDL9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc87Q8CDL9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc87Q8CDL9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc87Q8CDL9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc87Q8CDL9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc87Q8CDL9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc87Q8CDL9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc87Q8CDL9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc87Q8CDL9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc87Q8CDL9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc87Q8CDL9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc87Q8CDL9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc87Q8CDL9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc87Q8CDL9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc87Q8CDL9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc87Q8CDL9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc87Q8CDL9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc87Q8CDL9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc87Q8CDL9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc87Q8CDL9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc87Q8CDL9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc87Q8CDL9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc87Q8CDL9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc87Q8CDL9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc87Q8CDL9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc87Q8CDL9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc87Q8CDL9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms