Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ufl1Q8CCJ3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ufl1Q8CCJ3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ufl1Q8CCJ3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ufl1Q8CCJ3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ufl1Q8CCJ3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ufl1Q8CCJ3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ufl1Q8CCJ3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ufl1Q8CCJ3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ufl1Q8CCJ3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ufl1Q8CCJ3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ufl1Q8CCJ3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ufl1Q8CCJ3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ufl1Q8CCJ3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ufl1Q8CCJ3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ufl1Q8CCJ3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ufl1Q8CCJ3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ufl1Q8CCJ3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ufl1Q8CCJ3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ufl1Q8CCJ3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ufl1Q8CCJ3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ufl1Q8CCJ3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ufl1Q8CCJ3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ufl1Q8CCJ3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ufl1Q8CCJ3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ufl1Q8CCJ3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ufl1Q8CCJ3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ufl1Q8CCJ3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ufl1Q8CCJ3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ufl1Q8CCJ3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ufl1Q8CCJ3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ufl1Q8CCJ3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ufl1Q8CCJ3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ufl1Q8CCJ3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ufl1Q8CCJ3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ufl1Q8CCJ3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ufl1Q8CCJ3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ufl1Q8CCJ3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ufl1Q8CCJ3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ufl1Q8CCJ3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ufl1Q8CCJ3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ufl1Q8CCJ3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ufl1Q8CCJ3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ufl1Q8CCJ3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ufl1Q8CCJ3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ufl1Q8CCJ3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ufl1Q8CCJ3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ufl1Q8CCJ3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ufl1Q8CCJ3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ufl1Q8CCJ3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ufl1Q8CCJ3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ufl1Q8CCJ3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ufl1Q8CCJ3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ufl1Q8CCJ3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ufl1Q8CCJ3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ufl1Q8CCJ3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ufl1Q8CCJ3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ufl1Q8CCJ3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ufl1Q8CCJ3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ufl1Q8CCJ3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ufl1Q8CCJ3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ufl1Q8CCJ3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ufl1Q8CCJ3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ufl1Q8CCJ3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms