Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
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