Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAF4

Nhsl1, NHS-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhsl1Q8CAF4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nhsl1Q8CAF4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nhsl1Q8CAF4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nhsl1Q8CAF4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Nhsl1Q8CAF4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nhsl1Q8CAF4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nhsl1Q8CAF4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nhsl1Q8CAF4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nhsl1Q8CAF4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nhsl1Q8CAF4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nhsl1Q8CAF4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nhsl1Q8CAF4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nhsl1Q8CAF4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nhsl1Q8CAF4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Nhsl1Q8CAF4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nhsl1Q8CAF4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nhsl1Q8CAF4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nhsl1Q8CAF4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nhsl1Q8CAF4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nhsl1Q8CAF4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nhsl1Q8CAF4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nhsl1Q8CAF4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nhsl1Q8CAF4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nhsl1Q8CAF4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Nhsl1Q8CAF4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nhsl1Q8CAF4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Nhsl1Q8CAF4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nhsl1Q8CAF4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nhsl1Q8CAF4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Nhsl1Q8CAF4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nhsl1Q8CAF4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nhsl1Q8CAF4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nhsl1Q8CAF4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nhsl1Q8CAF4 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nhsl1Q8CAF4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nhsl1Q8CAF4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nhsl1Q8CAF4 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nhsl1Q8CAF4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Nhsl1Q8CAF4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Nhsl1Q8CAF4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nhsl1Q8CAF4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nhsl1Q8CAF4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nhsl1Q8CAF4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nhsl1Q8CAF4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nhsl1Q8CAF4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nhsl1Q8CAF4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nhsl1Q8CAF4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nhsl1Q8CAF4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nhsl1Q8CAF4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nhsl1Q8CAF4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nhsl1Q8CAF4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nhsl1Q8CAF4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nhsl1Q8CAF4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nhsl1Q8CAF4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nhsl1Q8CAF4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nhsl1Q8CAF4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nhsl1Q8CAF4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nhsl1Q8CAF4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nhsl1Q8CAF4 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nhsl1Q8CAF4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nhsl1Q8CAF4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nhsl1Q8CAF4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nhsl1Q8CAF4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nhsl1Q8CAF4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nhsl1Q8CAF4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nhsl1Q8CAF4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nhsl1Q8CAF4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nhsl1Q8CAF4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nhsl1Q8CAF4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nhsl1Q8CAF4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Nhsl1Q8CAF4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nhsl1Q8CAF4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nhsl1Q8CAF4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nhsl1Q8CAF4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nhsl1Q8CAF4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nhsl1Q8CAF4 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nhsl1Q8CAF4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nhsl1Q8CAF4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nhsl1Q8CAF4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nhsl1Q8CAF4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nhsl1Q8CAF4 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Nhsl1Q8CAF4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nhsl1Q8CAF4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nhsl1Q8CAF4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nhsl1Q8CAF4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nhsl1Q8CAF4 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nhsl1Q8CAF4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Nhsl1Q8CAF4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nhsl1Q8CAF4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nhsl1Q8CAF4 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Nhsl1Q8CAF4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms