Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg4aQ8C9S8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg4aQ8C9S8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg4aQ8C9S8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg4aQ8C9S8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg4aQ8C9S8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg4aQ8C9S8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg4aQ8C9S8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg4aQ8C9S8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg4aQ8C9S8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg4aQ8C9S8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg4aQ8C9S8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg4aQ8C9S8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg4aQ8C9S8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg4aQ8C9S8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg4aQ8C9S8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg4aQ8C9S8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg4aQ8C9S8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg4aQ8C9S8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg4aQ8C9S8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg4aQ8C9S8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg4aQ8C9S8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg4aQ8C9S8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg4aQ8C9S8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg4aQ8C9S8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg4aQ8C9S8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg4aQ8C9S8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg4aQ8C9S8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg4aQ8C9S8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg4aQ8C9S8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg4aQ8C9S8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg4aQ8C9S8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg4aQ8C9S8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg4aQ8C9S8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg4aQ8C9S8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg4aQ8C9S8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg4aQ8C9S8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg4aQ8C9S8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg4aQ8C9S8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg4aQ8C9S8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg4aQ8C9S8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg4aQ8C9S8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg4aQ8C9S8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg4aQ8C9S8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg4aQ8C9S8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg4aQ8C9S8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg4aQ8C9S8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg4aQ8C9S8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg4aQ8C9S8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atg4aQ8C9S8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atg4aQ8C9S8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atg4aQ8C9S8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atg4aQ8C9S8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
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