Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5Z9

4930504O13Rik, RIKEN cDNA 4930504O13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930504O13RikQ8C5Z9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4930504O13RikQ8C5Z9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
4930504O13RikQ8C5Z9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
4930504O13RikQ8C5Z9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
4930504O13RikQ8C5Z9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4930504O13RikQ8C5Z9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
4930504O13RikQ8C5Z9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4930504O13RikQ8C5Z9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4930504O13RikQ8C5Z9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4930504O13RikQ8C5Z9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4930504O13RikQ8C5Z9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4930504O13RikQ8C5Z9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4930504O13RikQ8C5Z9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4930504O13RikQ8C5Z9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4930504O13RikQ8C5Z9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4930504O13RikQ8C5Z9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4930504O13RikQ8C5Z9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
4930504O13RikQ8C5Z9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4930504O13RikQ8C5Z9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
4930504O13RikQ8C5Z9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4930504O13RikQ8C5Z9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
4930504O13RikQ8C5Z9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
4930504O13RikQ8C5Z9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
4930504O13RikQ8C5Z9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4930504O13RikQ8C5Z9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4930504O13RikQ8C5Z9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4930504O13RikQ8C5Z9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
4930504O13RikQ8C5Z9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930504O13RikQ8C5Z9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
4930504O13RikQ8C5Z9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930504O13RikQ8C5Z9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930504O13RikQ8C5Z9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930504O13RikQ8C5Z9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930504O13RikQ8C5Z9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930504O13RikQ8C5Z9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930504O13RikQ8C5Z9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930504O13RikQ8C5Z9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms