Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms