Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV16

Zfp398, Zinc finger protein 398, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp398Q8BV16 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp398Q8BV16 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp398Q8BV16 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp398Q8BV16 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp398Q8BV16 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp398Q8BV16 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp398Q8BV16 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp398Q8BV16 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp398Q8BV16 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp398Q8BV16 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp398Q8BV16 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp398Q8BV16 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp398Q8BV16 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp398Q8BV16 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp398Q8BV16 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp398Q8BV16 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp398Q8BV16 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp398Q8BV16 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp398Q8BV16 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp398Q8BV16 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp398Q8BV16 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp398Q8BV16 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp398Q8BV16 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp398Q8BV16 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp398Q8BV16 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp398Q8BV16 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp398Q8BV16 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp398Q8BV16 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp398Q8BV16 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp398Q8BV16 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp398Q8BV16 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp398Q8BV16 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp398Q8BV16 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp398Q8BV16 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Zfp398Q8BV16 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp398Q8BV16 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp398Q8BV16 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp398Q8BV16 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp398Q8BV16 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp398Q8BV16 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp398Q8BV16 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp398Q8BV16 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp398Q8BV16 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp398Q8BV16 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp398Q8BV16 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp398Q8BV16 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp398Q8BV16 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp398Q8BV16 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp398Q8BV16 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp398Q8BV16 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp398Q8BV16 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp398Q8BV16 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp398Q8BV16 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp398Q8BV16 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp398Q8BV16 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp398Q8BV16 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp398Q8BV16 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp398Q8BV16 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp398Q8BV16 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp398Q8BV16 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp398Q8BV16 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp398Q8BV16 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp398Q8BV16 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp398Q8BV16 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp398Q8BV16 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp398Q8BV16 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp398Q8BV16 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp398Q8BV16 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp398Q8BV16 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp398Q8BV16 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp398Q8BV16 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp398Q8BV16 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp398Q8BV16 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp398Q8BV16 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp398Q8BV16 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp398Q8BV16 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp398Q8BV16 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp398Q8BV16 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp398Q8BV16 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp398Q8BV16 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp398Q8BV16 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp398Q8BV16 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp398Q8BV16 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp398Q8BV16 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp398Q8BV16 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp398Q8BV16 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp398Q8BV16 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp398Q8BV16 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp398Q8BV16 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp398Q8BV16 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp398Q8BV16 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp398Q8BV16 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp398Q8BV16 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp398Q8BV16 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp398Q8BV16 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp398Q8BV16 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp398Q8BV16 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp398Q8BV16 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp398Q8BV16 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp398Q8BV16 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms