Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUV3

Gphn, Gephyrin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 769 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GphnQ8BUV3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GphnQ8BUV3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GphnQ8BUV3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GphnQ8BUV3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GphnQ8BUV3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GphnQ8BUV3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GphnQ8BUV3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GphnQ8BUV3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GphnQ8BUV3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GphnQ8BUV3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GphnQ8BUV3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GphnQ8BUV3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GphnQ8BUV3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
GphnQ8BUV3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GphnQ8BUV3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GphnQ8BUV3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
GphnQ8BUV3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GphnQ8BUV3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GphnQ8BUV3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GphnQ8BUV3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GphnQ8BUV3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GphnQ8BUV3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GphnQ8BUV3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GphnQ8BUV3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GphnQ8BUV3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GphnQ8BUV3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GphnQ8BUV3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GphnQ8BUV3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GphnQ8BUV3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GphnQ8BUV3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GphnQ8BUV3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GphnQ8BUV3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GphnQ8BUV3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GphnQ8BUV3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GphnQ8BUV3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GphnQ8BUV3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GphnQ8BUV3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GphnQ8BUV3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GphnQ8BUV3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GphnQ8BUV3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GphnQ8BUV3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GphnQ8BUV3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GphnQ8BUV3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GphnQ8BUV3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GphnQ8BUV3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GphnQ8BUV3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GphnQ8BUV3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GphnQ8BUV3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GphnQ8BUV3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GphnQ8BUV3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GphnQ8BUV3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GphnQ8BUV3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GphnQ8BUV3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GphnQ8BUV3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GphnQ8BUV3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GphnQ8BUV3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GphnQ8BUV3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GphnQ8BUV3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GphnQ8BUV3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GphnQ8BUV3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GphnQ8BUV3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GphnQ8BUV3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GphnQ8BUV3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GphnQ8BUV3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GphnQ8BUV3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GphnQ8BUV3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GphnQ8BUV3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GphnQ8BUV3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GphnQ8BUV3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GphnQ8BUV3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GphnQ8BUV3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GphnQ8BUV3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GphnQ8BUV3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GphnQ8BUV3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GphnQ8BUV3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GphnQ8BUV3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GphnQ8BUV3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GphnQ8BUV3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GphnQ8BUV3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GphnQ8BUV3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GphnQ8BUV3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GphnQ8BUV3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GphnQ8BUV3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GphnQ8BUV3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GphnQ8BUV3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GphnQ8BUV3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GphnQ8BUV3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GphnQ8BUV3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GphnQ8BUV3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GphnQ8BUV3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GphnQ8BUV3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GphnQ8BUV3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GphnQ8BUV3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GphnQ8BUV3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GphnQ8BUV3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GphnQ8BUV3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GphnQ8BUV3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GphnQ8BUV3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GphnQ8BUV3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GphnQ8BUV3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms