Protein–RNA interactions for Protein: Q8BR07

Bicd1, Protein bicaudal D homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bicd1Q8BR07 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bicd1Q8BR07 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bicd1Q8BR07 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bicd1Q8BR07 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bicd1Q8BR07 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bicd1Q8BR07 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bicd1Q8BR07 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bicd1Q8BR07 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bicd1Q8BR07 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bicd1Q8BR07 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bicd1Q8BR07 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bicd1Q8BR07 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bicd1Q8BR07 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Bicd1Q8BR07 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Bicd1Q8BR07 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bicd1Q8BR07 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms