Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII3

D130040H23Rik, RIKEN cDNA D130040H23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130040H23RikQ8BII3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
D130040H23RikQ8BII3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms