Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW3

Bhlhe23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe23Q8BGW3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms