Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Atg4dQ8BGV9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms