Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vipas39Q8BGQ1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vipas39Q8BGQ1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vipas39Q8BGQ1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Vipas39Q8BGQ1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vipas39Q8BGQ1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vipas39Q8BGQ1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vipas39Q8BGQ1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vipas39Q8BGQ1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vipas39Q8BGQ1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vipas39Q8BGQ1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vipas39Q8BGQ1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vipas39Q8BGQ1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vipas39Q8BGQ1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Vipas39Q8BGQ1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vipas39Q8BGQ1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vipas39Q8BGQ1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vipas39Q8BGQ1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vipas39Q8BGQ1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vipas39Q8BGQ1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vipas39Q8BGQ1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vipas39Q8BGQ1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vipas39Q8BGQ1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vipas39Q8BGQ1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vipas39Q8BGQ1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vipas39Q8BGQ1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vipas39Q8BGQ1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vipas39Q8BGQ1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vipas39Q8BGQ1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vipas39Q8BGQ1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vipas39Q8BGQ1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vipas39Q8BGQ1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vipas39Q8BGQ1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vipas39Q8BGQ1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vipas39Q8BGQ1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vipas39Q8BGQ1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Vipas39Q8BGQ1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Vipas39Q8BGQ1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Vipas39Q8BGQ1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vipas39Q8BGQ1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vipas39Q8BGQ1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vipas39Q8BGQ1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vipas39Q8BGQ1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vipas39Q8BGQ1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vipas39Q8BGQ1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vipas39Q8BGQ1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vipas39Q8BGQ1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vipas39Q8BGQ1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vipas39Q8BGQ1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vipas39Q8BGQ1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vipas39Q8BGQ1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vipas39Q8BGQ1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Vipas39Q8BGQ1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
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Vipas39Q8BGQ1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
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Vipas39Q8BGQ1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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Vipas39Q8BGQ1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms