Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG71

Trmt12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt12Q8BG71 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms