Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFT6

Jmjd4, JmjC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd4Q8BFT6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Jmjd4Q8BFT6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Jmjd4Q8BFT6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Jmjd4Q8BFT6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Jmjd4Q8BFT6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Jmjd4Q8BFT6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Jmjd4Q8BFT6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Jmjd4Q8BFT6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Jmjd4Q8BFT6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Jmjd4Q8BFT6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Jmjd4Q8BFT6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Jmjd4Q8BFT6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Jmjd4Q8BFT6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Jmjd4Q8BFT6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Jmjd4Q8BFT6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Jmjd4Q8BFT6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Jmjd4Q8BFT6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Jmjd4Q8BFT6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Jmjd4Q8BFT6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Jmjd4Q8BFT6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Jmjd4Q8BFT6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Jmjd4Q8BFT6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Jmjd4Q8BFT6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Jmjd4Q8BFT6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Jmjd4Q8BFT6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Jmjd4Q8BFT6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Jmjd4Q8BFT6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Jmjd4Q8BFT6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Jmjd4Q8BFT6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Jmjd4Q8BFT6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Jmjd4Q8BFT6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Jmjd4Q8BFT6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Jmjd4Q8BFT6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Jmjd4Q8BFT6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Jmjd4Q8BFT6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Jmjd4Q8BFT6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Jmjd4Q8BFT6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Jmjd4Q8BFT6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Jmjd4Q8BFT6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Jmjd4Q8BFT6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Jmjd4Q8BFT6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Jmjd4Q8BFT6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Jmjd4Q8BFT6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Jmjd4Q8BFT6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Jmjd4Q8BFT6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Jmjd4Q8BFT6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Jmjd4Q8BFT6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Jmjd4Q8BFT6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Jmjd4Q8BFT6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Jmjd4Q8BFT6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Jmjd4Q8BFT6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Jmjd4Q8BFT6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Jmjd4Q8BFT6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Jmjd4Q8BFT6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Jmjd4Q8BFT6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Jmjd4Q8BFT6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Jmjd4Q8BFT6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Jmjd4Q8BFT6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Jmjd4Q8BFT6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Jmjd4Q8BFT6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Jmjd4Q8BFT6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Jmjd4Q8BFT6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Jmjd4Q8BFT6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Jmjd4Q8BFT6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Jmjd4Q8BFT6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Jmjd4Q8BFT6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Jmjd4Q8BFT6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Jmjd4Q8BFT6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Jmjd4Q8BFT6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Jmjd4Q8BFT6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Jmjd4Q8BFT6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Jmjd4Q8BFT6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Jmjd4Q8BFT6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Jmjd4Q8BFT6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Jmjd4Q8BFT6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Jmjd4Q8BFT6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Jmjd4Q8BFT6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Jmjd4Q8BFT6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Jmjd4Q8BFT6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Jmjd4Q8BFT6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Jmjd4Q8BFT6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Jmjd4Q8BFT6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Jmjd4Q8BFT6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Jmjd4Q8BFT6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Jmjd4Q8BFT6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Jmjd4Q8BFT6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Jmjd4Q8BFT6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Jmjd4Q8BFT6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Jmjd4Q8BFT6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Jmjd4Q8BFT6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Jmjd4Q8BFT6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Jmjd4Q8BFT6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Jmjd4Q8BFT6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Jmjd4Q8BFT6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Jmjd4Q8BFT6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Jmjd4Q8BFT6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Jmjd4Q8BFT6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Jmjd4Q8BFT6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Jmjd4Q8BFT6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Jmjd4Q8BFT6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms