Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms