Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Liat1Q810M6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Liat1Q810M6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Liat1Q810M6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Liat1Q810M6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Liat1Q810M6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Liat1Q810M6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Liat1Q810M6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Liat1Q810M6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Liat1Q810M6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Liat1Q810M6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Liat1Q810M6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Liat1Q810M6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Liat1Q810M6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Liat1Q810M6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Liat1Q810M6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Liat1Q810M6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Liat1Q810M6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Liat1Q810M6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Liat1Q810M6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Liat1Q810M6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Liat1Q810M6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.1 ms