Protein–RNA interactions for Protein: Q810L4

Tmem39b, Transmembrane protein 39B, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39bQ810L4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tmem39bQ810L4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tmem39bQ810L4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem39bQ810L4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem39bQ810L4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem39bQ810L4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem39bQ810L4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem39bQ810L4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem39bQ810L4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem39bQ810L4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem39bQ810L4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem39bQ810L4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem39bQ810L4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem39bQ810L4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem39bQ810L4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem39bQ810L4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem39bQ810L4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem39bQ810L4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tmem39bQ810L4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem39bQ810L4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem39bQ810L4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem39bQ810L4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem39bQ810L4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem39bQ810L4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem39bQ810L4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem39bQ810L4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tmem39bQ810L4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tmem39bQ810L4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tmem39bQ810L4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tmem39bQ810L4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tmem39bQ810L4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem39bQ810L4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem39bQ810L4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem39bQ810L4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem39bQ810L4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem39bQ810L4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem39bQ810L4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem39bQ810L4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tmem39bQ810L4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tmem39bQ810L4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem39bQ810L4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem39bQ810L4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem39bQ810L4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem39bQ810L4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tmem39bQ810L4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem39bQ810L4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem39bQ810L4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem39bQ810L4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem39bQ810L4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem39bQ810L4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem39bQ810L4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem39bQ810L4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem39bQ810L4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem39bQ810L4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem39bQ810L4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem39bQ810L4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem39bQ810L4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem39bQ810L4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem39bQ810L4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem39bQ810L4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tmem39bQ810L4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms