Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ChfrQ810L3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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