Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZA4

Pkhd1l1, Fibrocystin-L, mousemouse

Predictions only

Length 4,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkhd1l1Q80ZA4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms