Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrfn4Q80XU8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrfn4Q80XU8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrfn4Q80XU8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrfn4Q80XU8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrfn4Q80XU8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrfn4Q80XU8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrfn4Q80XU8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrfn4Q80XU8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrfn4Q80XU8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrfn4Q80XU8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrfn4Q80XU8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrfn4Q80XU8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrfn4Q80XU8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrfn4Q80XU8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrfn4Q80XU8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrfn4Q80XU8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrfn4Q80XU8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrfn4Q80XU8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrfn4Q80XU8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrfn4Q80XU8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrfn4Q80XU8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrfn4Q80XU8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrfn4Q80XU8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrfn4Q80XU8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrfn4Q80XU8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrfn4Q80XU8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrfn4Q80XU8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrfn4Q80XU8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrfn4Q80XU8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrfn4Q80XU8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrfn4Q80XU8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrfn4Q80XU8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrfn4Q80XU8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrfn4Q80XU8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrfn4Q80XU8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrfn4Q80XU8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrfn4Q80XU8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrfn4Q80XU8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrfn4Q80XU8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrfn4Q80XU8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrfn4Q80XU8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrfn4Q80XU8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrfn4Q80XU8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrfn4Q80XU8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrfn4Q80XU8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrfn4Q80XU8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrfn4Q80XU8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrfn4Q80XU8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrfn4Q80XU8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrfn4Q80XU8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrfn4Q80XU8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrfn4Q80XU8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrfn4Q80XU8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrfn4Q80XU8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrfn4Q80XU8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrfn4Q80XU8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrfn4Q80XU8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrfn4Q80XU8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrfn4Q80XU8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrfn4Q80XU8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrfn4Q80XU8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrfn4Q80XU8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrfn4Q80XU8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrfn4Q80XU8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrfn4Q80XU8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrfn4Q80XU8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrfn4Q80XU8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrfn4Q80XU8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrfn4Q80XU8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrfn4Q80XU8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrfn4Q80XU8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrfn4Q80XU8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrfn4Q80XU8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrfn4Q80XU8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrfn4Q80XU8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrfn4Q80XU8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrfn4Q80XU8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrfn4Q80XU8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrfn4Q80XU8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrfn4Q80XU8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrfn4Q80XU8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrfn4Q80XU8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrfn4Q80XU8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrfn4Q80XU8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrfn4Q80XU8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrfn4Q80XU8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrfn4Q80XU8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrfn4Q80XU8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrfn4Q80XU8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrfn4Q80XU8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrfn4Q80XU8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrfn4Q80XU8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrfn4Q80XU8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrfn4Q80XU8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrfn4Q80XU8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrfn4Q80XU8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrfn4Q80XU8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrfn4Q80XU8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrfn4Q80XU8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms