Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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