Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc1Q80VQ1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc1Q80VQ1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc1Q80VQ1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc1Q80VQ1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc1Q80VQ1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc1Q80VQ1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc1Q80VQ1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc1Q80VQ1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc1Q80VQ1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc1Q80VQ1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc1Q80VQ1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc1Q80VQ1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc1Q80VQ1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc1Q80VQ1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc1Q80VQ1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc1Q80VQ1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc1Q80VQ1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc1Q80VQ1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc1Q80VQ1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc1Q80VQ1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc1Q80VQ1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lrrc1Q80VQ1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lrrc1Q80VQ1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc1Q80VQ1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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