Protein–RNA interactions for Protein: Q80UJ7

Rab3gap1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3gap1Q80UJ7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rab3gap1Q80UJ7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rab3gap1Q80UJ7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rab3gap1Q80UJ7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rab3gap1Q80UJ7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab3gap1Q80UJ7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab3gap1Q80UJ7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab3gap1Q80UJ7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab3gap1Q80UJ7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab3gap1Q80UJ7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab3gap1Q80UJ7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab3gap1Q80UJ7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab3gap1Q80UJ7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab3gap1Q80UJ7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab3gap1Q80UJ7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab3gap1Q80UJ7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab3gap1Q80UJ7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab3gap1Q80UJ7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab3gap1Q80UJ7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab3gap1Q80UJ7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab3gap1Q80UJ7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab3gap1Q80UJ7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab3gap1Q80UJ7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab3gap1Q80UJ7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab3gap1Q80UJ7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab3gap1Q80UJ7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab3gap1Q80UJ7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab3gap1Q80UJ7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab3gap1Q80UJ7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab3gap1Q80UJ7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab3gap1Q80UJ7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab3gap1Q80UJ7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab3gap1Q80UJ7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab3gap1Q80UJ7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab3gap1Q80UJ7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab3gap1Q80UJ7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab3gap1Q80UJ7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab3gap1Q80UJ7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab3gap1Q80UJ7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab3gap1Q80UJ7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab3gap1Q80UJ7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab3gap1Q80UJ7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab3gap1Q80UJ7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab3gap1Q80UJ7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab3gap1Q80UJ7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab3gap1Q80UJ7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab3gap1Q80UJ7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab3gap1Q80UJ7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab3gap1Q80UJ7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab3gap1Q80UJ7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab3gap1Q80UJ7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab3gap1Q80UJ7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab3gap1Q80UJ7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab3gap1Q80UJ7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab3gap1Q80UJ7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab3gap1Q80UJ7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab3gap1Q80UJ7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab3gap1Q80UJ7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab3gap1Q80UJ7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab3gap1Q80UJ7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab3gap1Q80UJ7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab3gap1Q80UJ7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab3gap1Q80UJ7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rab3gap1Q80UJ7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Rab3gap1Q80UJ7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab3gap1Q80UJ7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab3gap1Q80UJ7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab3gap1Q80UJ7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab3gap1Q80UJ7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab3gap1Q80UJ7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab3gap1Q80UJ7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab3gap1Q80UJ7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab3gap1Q80UJ7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab3gap1Q80UJ7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab3gap1Q80UJ7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab3gap1Q80UJ7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab3gap1Q80UJ7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab3gap1Q80UJ7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab3gap1Q80UJ7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab3gap1Q80UJ7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab3gap1Q80UJ7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab3gap1Q80UJ7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab3gap1Q80UJ7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab3gap1Q80UJ7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab3gap1Q80UJ7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab3gap1Q80UJ7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab3gap1Q80UJ7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab3gap1Q80UJ7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rab3gap1Q80UJ7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rab3gap1Q80UJ7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rab3gap1Q80UJ7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rab3gap1Q80UJ7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rab3gap1Q80UJ7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rab3gap1Q80UJ7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rab3gap1Q80UJ7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rab3gap1Q80UJ7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rab3gap1Q80UJ7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rab3gap1Q80UJ7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rab3gap1Q80UJ7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rab3gap1Q80UJ7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms