Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms