Protein–RNA interactions for Protein: Q80U49

Cep170b, Centrosomal protein of 170 kDa protein B, mousemouse

Predictions only

Length 1,574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170bQ80U49 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cep170bQ80U49 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cep170bQ80U49 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cep170bQ80U49 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cep170bQ80U49 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cep170bQ80U49 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Cep170bQ80U49 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cep170bQ80U49 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cep170bQ80U49 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cep170bQ80U49 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cep170bQ80U49 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cep170bQ80U49 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cep170bQ80U49 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cep170bQ80U49 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cep170bQ80U49 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cep170bQ80U49 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cep170bQ80U49 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cep170bQ80U49 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cep170bQ80U49 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Cep170bQ80U49 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cep170bQ80U49 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Cep170bQ80U49 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cep170bQ80U49 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cep170bQ80U49 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cep170bQ80U49 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cep170bQ80U49 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cep170bQ80U49 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cep170bQ80U49 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cep170bQ80U49 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Cep170bQ80U49 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cep170bQ80U49 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cep170bQ80U49 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Cep170bQ80U49 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cep170bQ80U49 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Cep170bQ80U49 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cep170bQ80U49 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cep170bQ80U49 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cep170bQ80U49 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cep170bQ80U49 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cep170bQ80U49 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cep170bQ80U49 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cep170bQ80U49 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cep170bQ80U49 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cep170bQ80U49 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cep170bQ80U49 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Cep170bQ80U49 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cep170bQ80U49 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cep170bQ80U49 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cep170bQ80U49 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cep170bQ80U49 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cep170bQ80U49 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cep170bQ80U49 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cep170bQ80U49 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cep170bQ80U49 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cep170bQ80U49 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cep170bQ80U49 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cep170bQ80U49 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cep170bQ80U49 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cep170bQ80U49 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cep170bQ80U49 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cep170bQ80U49 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cep170bQ80U49 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cep170bQ80U49 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cep170bQ80U49 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cep170bQ80U49 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cep170bQ80U49 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cep170bQ80U49 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cep170bQ80U49 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cep170bQ80U49 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cep170bQ80U49 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cep170bQ80U49 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cep170bQ80U49 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cep170bQ80U49 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cep170bQ80U49 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Cep170bQ80U49 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cep170bQ80U49 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cep170bQ80U49 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cep170bQ80U49 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cep170bQ80U49 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cep170bQ80U49 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cep170bQ80U49 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cep170bQ80U49 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cep170bQ80U49 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cep170bQ80U49 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cep170bQ80U49 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cep170bQ80U49 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cep170bQ80U49 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cep170bQ80U49 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cep170bQ80U49 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Cep170bQ80U49 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cep170bQ80U49 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cep170bQ80U49 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Cep170bQ80U49 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cep170bQ80U49 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cep170bQ80U49 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cep170bQ80U49 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cep170bQ80U49 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cep170bQ80U49 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cep170bQ80U49 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cep170bQ80U49 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms