Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
NischQ80TM9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
NischQ80TM9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.85■■■■□ 3.81
NischQ80TM9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC38.85■■■■□ 3.81
NischQ80TM9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
NischQ80TM9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
NischQ80TM9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
NischQ80TM9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC38.84■■■■□ 3.81
NischQ80TM9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
NischQ80TM9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
NischQ80TM9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
NischQ80TM9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
NischQ80TM9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.83■■■■□ 3.81
NischQ80TM9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC38.82■■■■□ 3.81
NischQ80TM9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
NischQ80TM9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
NischQ80TM9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.82■■■■□ 3.8
NischQ80TM9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
NischQ80TM9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
NischQ80TM9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
NischQ80TM9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
NischQ80TM9 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
NischQ80TM9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
NischQ80TM9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
NischQ80TM9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
NischQ80TM9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC38.8■■■■□ 3.8
NischQ80TM9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
NischQ80TM9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
NischQ80TM9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC38.8■■■■□ 3.8
NischQ80TM9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
NischQ80TM9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
NischQ80TM9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
NischQ80TM9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC38.79■■■■□ 3.8
NischQ80TM9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
NischQ80TM9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC38.79■■■■□ 3.8
NischQ80TM9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
NischQ80TM9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
NischQ80TM9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
NischQ80TM9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
NischQ80TM9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.78■■■■□ 3.8
NischQ80TM9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.78■■■■□ 3.8
NischQ80TM9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
NischQ80TM9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
NischQ80TM9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC38.78■■■■□ 3.8
NischQ80TM9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
NischQ80TM9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
NischQ80TM9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
NischQ80TM9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
NischQ80TM9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
NischQ80TM9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC38.77■■■■□ 3.8
NischQ80TM9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
NischQ80TM9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
NischQ80TM9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC38.75■■■■□ 3.79
NischQ80TM9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC38.75■■■■□ 3.79
NischQ80TM9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
NischQ80TM9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
NischQ80TM9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
NischQ80TM9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
NischQ80TM9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
NischQ80TM9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
NischQ80TM9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
NischQ80TM9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC38.73■■■■□ 3.79
NischQ80TM9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
NischQ80TM9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
NischQ80TM9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
NischQ80TM9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
NischQ80TM9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
NischQ80TM9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
NischQ80TM9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
NischQ80TM9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
NischQ80TM9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
NischQ80TM9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
NischQ80TM9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
NischQ80TM9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
NischQ80TM9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
NischQ80TM9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
NischQ80TM9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
NischQ80TM9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
NischQ80TM9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
NischQ80TM9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC38.7■■■■□ 3.79
NischQ80TM9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC38.7■■■■□ 3.79
NischQ80TM9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
NischQ80TM9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
NischQ80TM9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
NischQ80TM9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
NischQ80TM9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
NischQ80TM9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
NischQ80TM9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC38.7■■■■□ 3.79
NischQ80TM9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
NischQ80TM9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
NischQ80TM9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
NischQ80TM9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
NischQ80TM9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
NischQ80TM9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
NischQ80TM9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
NischQ80TM9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
NischQ80TM9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
NischQ80TM9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
NischQ80TM9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
NischQ80TM9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
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