Protein–RNA interactions for Protein: Q80TJ7

Phf8, Histone lysine demethylase PHF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,023 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf8Q80TJ7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Phf8Q80TJ7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms