Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSL0

Ifnk, Interferon kappa, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnkQ7TSL0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms