Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSK3

Pcdh8, Protocadherin-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh8Q7TSK3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms