Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcnf1Q7TSH7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcnf1Q7TSH7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcnf1Q7TSH7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcnf1Q7TSH7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcnf1Q7TSH7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcnf1Q7TSH7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcnf1Q7TSH7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcnf1Q7TSH7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcnf1Q7TSH7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Kcnf1Q7TSH7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kcnf1Q7TSH7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kcnf1Q7TSH7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kcnf1Q7TSH7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Kcnf1Q7TSH7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kcnf1Q7TSH7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kcnf1Q7TSH7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kcnf1Q7TSH7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kcnf1Q7TSH7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kcnf1Q7TSH7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kcnf1Q7TSH7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kcnf1Q7TSH7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kcnf1Q7TSH7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kcnf1Q7TSH7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kcnf1Q7TSH7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kcnf1Q7TSH7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kcnf1Q7TSH7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kcnf1Q7TSH7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kcnf1Q7TSH7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kcnf1Q7TSH7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kcnf1Q7TSH7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kcnf1Q7TSH7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kcnf1Q7TSH7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kcnf1Q7TSH7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kcnf1Q7TSH7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kcnf1Q7TSH7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kcnf1Q7TSH7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kcnf1Q7TSH7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kcnf1Q7TSH7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kcnf1Q7TSH7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kcnf1Q7TSH7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kcnf1Q7TSH7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kcnf1Q7TSH7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kcnf1Q7TSH7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kcnf1Q7TSH7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kcnf1Q7TSH7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kcnf1Q7TSH7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kcnf1Q7TSH7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kcnf1Q7TSH7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kcnf1Q7TSH7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kcnf1Q7TSH7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kcnf1Q7TSH7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kcnf1Q7TSH7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kcnf1Q7TSH7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kcnf1Q7TSH7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kcnf1Q7TSH7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kcnf1Q7TSH7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Kcnf1Q7TSH7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kcnf1Q7TSH7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kcnf1Q7TSH7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kcnf1Q7TSH7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kcnf1Q7TSH7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kcnf1Q7TSH7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Kcnf1Q7TSH7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kcnf1Q7TSH7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kcnf1Q7TSH7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Kcnf1Q7TSH7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kcnf1Q7TSH7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kcnf1Q7TSH7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kcnf1Q7TSH7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kcnf1Q7TSH7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kcnf1Q7TSH7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kcnf1Q7TSH7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kcnf1Q7TSH7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kcnf1Q7TSH7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kcnf1Q7TSH7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kcnf1Q7TSH7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kcnf1Q7TSH7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kcnf1Q7TSH7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kcnf1Q7TSH7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kcnf1Q7TSH7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kcnf1Q7TSH7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kcnf1Q7TSH7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Kcnf1Q7TSH7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kcnf1Q7TSH7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kcnf1Q7TSH7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kcnf1Q7TSH7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kcnf1Q7TSH7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kcnf1Q7TSH7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kcnf1Q7TSH7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kcnf1Q7TSH7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kcnf1Q7TSH7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kcnf1Q7TSH7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kcnf1Q7TSH7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kcnf1Q7TSH7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kcnf1Q7TSH7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kcnf1Q7TSH7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kcnf1Q7TSH7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kcnf1Q7TSH7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kcnf1Q7TSH7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms