Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccp110Q7TSH4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccp110Q7TSH4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccp110Q7TSH4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccp110Q7TSH4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccp110Q7TSH4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccp110Q7TSH4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccp110Q7TSH4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccp110Q7TSH4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccp110Q7TSH4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccp110Q7TSH4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccp110Q7TSH4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccp110Q7TSH4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccp110Q7TSH4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccp110Q7TSH4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccp110Q7TSH4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccp110Q7TSH4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccp110Q7TSH4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccp110Q7TSH4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccp110Q7TSH4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccp110Q7TSH4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccp110Q7TSH4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccp110Q7TSH4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccp110Q7TSH4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccp110Q7TSH4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccp110Q7TSH4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccp110Q7TSH4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccp110Q7TSH4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccp110Q7TSH4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccp110Q7TSH4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccp110Q7TSH4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccp110Q7TSH4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccp110Q7TSH4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccp110Q7TSH4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccp110Q7TSH4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccp110Q7TSH4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccp110Q7TSH4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccp110Q7TSH4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccp110Q7TSH4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccp110Q7TSH4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccp110Q7TSH4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccp110Q7TSH4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccp110Q7TSH4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccp110Q7TSH4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccp110Q7TSH4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccp110Q7TSH4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccp110Q7TSH4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccp110Q7TSH4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccp110Q7TSH4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccp110Q7TSH4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccp110Q7TSH4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccp110Q7TSH4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccp110Q7TSH4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccp110Q7TSH4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccp110Q7TSH4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccp110Q7TSH4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccp110Q7TSH4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccp110Q7TSH4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccp110Q7TSH4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccp110Q7TSH4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccp110Q7TSH4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccp110Q7TSH4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccp110Q7TSH4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccp110Q7TSH4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccp110Q7TSH4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccp110Q7TSH4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccp110Q7TSH4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccp110Q7TSH4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccp110Q7TSH4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccp110Q7TSH4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccp110Q7TSH4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccp110Q7TSH4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccp110Q7TSH4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccp110Q7TSH4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccp110Q7TSH4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccp110Q7TSH4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccp110Q7TSH4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccp110Q7TSH4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccp110Q7TSH4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccp110Q7TSH4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccp110Q7TSH4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccp110Q7TSH4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccp110Q7TSH4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccp110Q7TSH4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccp110Q7TSH4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccp110Q7TSH4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccp110Q7TSH4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccp110Q7TSH4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccp110Q7TSH4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccp110Q7TSH4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccp110Q7TSH4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccp110Q7TSH4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccp110Q7TSH4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccp110Q7TSH4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccp110Q7TSH4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccp110Q7TSH4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccp110Q7TSH4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccp110Q7TSH4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccp110Q7TSH4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccp110Q7TSH4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms