Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC3

Nek5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek5Q7TSC3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nek5Q7TSC3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nek5Q7TSC3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nek5Q7TSC3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nek5Q7TSC3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nek5Q7TSC3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nek5Q7TSC3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nek5Q7TSC3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nek5Q7TSC3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nek5Q7TSC3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nek5Q7TSC3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nek5Q7TSC3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nek5Q7TSC3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nek5Q7TSC3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nek5Q7TSC3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nek5Q7TSC3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nek5Q7TSC3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nek5Q7TSC3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nek5Q7TSC3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nek5Q7TSC3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nek5Q7TSC3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nek5Q7TSC3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nek5Q7TSC3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nek5Q7TSC3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nek5Q7TSC3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nek5Q7TSC3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nek5Q7TSC3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nek5Q7TSC3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nek5Q7TSC3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nek5Q7TSC3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nek5Q7TSC3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nek5Q7TSC3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nek5Q7TSC3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Nek5Q7TSC3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nek5Q7TSC3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nek5Q7TSC3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nek5Q7TSC3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nek5Q7TSC3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Nek5Q7TSC3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nek5Q7TSC3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nek5Q7TSC3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nek5Q7TSC3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Nek5Q7TSC3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nek5Q7TSC3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nek5Q7TSC3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nek5Q7TSC3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nek5Q7TSC3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms