Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQK5

Ccdc93, Coiled-coil domain-containing protein 93, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc93Q7TQK5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc93Q7TQK5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc93Q7TQK5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc93Q7TQK5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc93Q7TQK5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc93Q7TQK5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc93Q7TQK5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc93Q7TQK5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc93Q7TQK5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc93Q7TQK5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc93Q7TQK5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc93Q7TQK5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc93Q7TQK5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc93Q7TQK5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc93Q7TQK5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc93Q7TQK5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc93Q7TQK5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc93Q7TQK5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc93Q7TQK5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc93Q7TQK5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc93Q7TQK5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc93Q7TQK5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc93Q7TQK5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc93Q7TQK5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc93Q7TQK5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc93Q7TQK5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc93Q7TQK5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc93Q7TQK5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc93Q7TQK5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc93Q7TQK5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc93Q7TQK5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc93Q7TQK5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc93Q7TQK5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc93Q7TQK5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc93Q7TQK5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc93Q7TQK5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc93Q7TQK5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc93Q7TQK5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc93Q7TQK5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc93Q7TQK5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc93Q7TQK5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc93Q7TQK5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc93Q7TQK5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc93Q7TQK5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc93Q7TQK5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc93Q7TQK5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc93Q7TQK5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc93Q7TQK5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc93Q7TQK5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc93Q7TQK5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc93Q7TQK5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc93Q7TQK5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc93Q7TQK5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc93Q7TQK5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc93Q7TQK5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc93Q7TQK5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc93Q7TQK5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc93Q7TQK5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc93Q7TQK5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc93Q7TQK5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc93Q7TQK5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc93Q7TQK5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc93Q7TQK5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc93Q7TQK5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc93Q7TQK5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc93Q7TQK5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc93Q7TQK5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc93Q7TQK5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc93Q7TQK5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc93Q7TQK5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc93Q7TQK5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc93Q7TQK5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc93Q7TQK5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc93Q7TQK5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc93Q7TQK5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc93Q7TQK5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc93Q7TQK5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc93Q7TQK5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc93Q7TQK5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc93Q7TQK5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc93Q7TQK5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc93Q7TQK5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc93Q7TQK5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc93Q7TQK5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc93Q7TQK5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc93Q7TQK5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc93Q7TQK5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc93Q7TQK5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc93Q7TQK5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc93Q7TQK5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc93Q7TQK5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc93Q7TQK5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc93Q7TQK5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc93Q7TQK5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc93Q7TQK5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc93Q7TQK5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc93Q7TQK5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc93Q7TQK5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc93Q7TQK5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc93Q7TQK5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms