Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms