Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prrc2bQ7TPM1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prrc2bQ7TPM1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prrc2bQ7TPM1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prrc2bQ7TPM1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prrc2bQ7TPM1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prrc2bQ7TPM1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prrc2bQ7TPM1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prrc2bQ7TPM1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prrc2bQ7TPM1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prrc2bQ7TPM1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prrc2bQ7TPM1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prrc2bQ7TPM1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prrc2bQ7TPM1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prrc2bQ7TPM1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Prrc2bQ7TPM1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Prrc2bQ7TPM1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Prrc2bQ7TPM1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Prrc2bQ7TPM1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Prrc2bQ7TPM1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Prrc2bQ7TPM1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Prrc2bQ7TPM1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Prrc2bQ7TPM1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Prrc2bQ7TPM1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prrc2bQ7TPM1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Prrc2bQ7TPM1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prrc2bQ7TPM1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prrc2bQ7TPM1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prrc2bQ7TPM1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prrc2bQ7TPM1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prrc2bQ7TPM1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prrc2bQ7TPM1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prrc2bQ7TPM1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prrc2bQ7TPM1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prrc2bQ7TPM1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prrc2bQ7TPM1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Prrc2bQ7TPM1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prrc2bQ7TPM1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prrc2bQ7TPM1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prrc2bQ7TPM1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prrc2bQ7TPM1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prrc2bQ7TPM1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prrc2bQ7TPM1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Prrc2bQ7TPM1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prrc2bQ7TPM1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prrc2bQ7TPM1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prrc2bQ7TPM1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prrc2bQ7TPM1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prrc2bQ7TPM1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prrc2bQ7TPM1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prrc2bQ7TPM1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prrc2bQ7TPM1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prrc2bQ7TPM1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prrc2bQ7TPM1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prrc2bQ7TPM1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prrc2bQ7TPM1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Prrc2bQ7TPM1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prrc2bQ7TPM1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prrc2bQ7TPM1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prrc2bQ7TPM1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prrc2bQ7TPM1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prrc2bQ7TPM1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prrc2bQ7TPM1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Prrc2bQ7TPM1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prrc2bQ7TPM1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prrc2bQ7TPM1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prrc2bQ7TPM1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prrc2bQ7TPM1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prrc2bQ7TPM1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prrc2bQ7TPM1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prrc2bQ7TPM1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prrc2bQ7TPM1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prrc2bQ7TPM1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prrc2bQ7TPM1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prrc2bQ7TPM1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prrc2bQ7TPM1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prrc2bQ7TPM1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prrc2bQ7TPM1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prrc2bQ7TPM1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prrc2bQ7TPM1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prrc2bQ7TPM1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prrc2bQ7TPM1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Prrc2bQ7TPM1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prrc2bQ7TPM1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prrc2bQ7TPM1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prrc2bQ7TPM1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Prrc2bQ7TPM1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prrc2bQ7TPM1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prrc2bQ7TPM1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prrc2bQ7TPM1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prrc2bQ7TPM1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Prrc2bQ7TPM1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prrc2bQ7TPM1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prrc2bQ7TPM1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prrc2bQ7TPM1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prrc2bQ7TPM1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prrc2bQ7TPM1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prrc2bQ7TPM1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms