Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms