Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMB3

Ppp1r3c, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3C, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r3cQ7TMB3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ppp1r3cQ7TMB3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppp1r3cQ7TMB3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ppp1r3cQ7TMB3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppp1r3cQ7TMB3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppp1r3cQ7TMB3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppp1r3cQ7TMB3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ppp1r3cQ7TMB3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ppp1r3cQ7TMB3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ppp1r3cQ7TMB3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ppp1r3cQ7TMB3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ppp1r3cQ7TMB3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ppp1r3cQ7TMB3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Ppp1r3cQ7TMB3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ppp1r3cQ7TMB3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppp1r3cQ7TMB3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ppp1r3cQ7TMB3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppp1r3cQ7TMB3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ppp1r3cQ7TMB3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ppp1r3cQ7TMB3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppp1r3cQ7TMB3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppp1r3cQ7TMB3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppp1r3cQ7TMB3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppp1r3cQ7TMB3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppp1r3cQ7TMB3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ppp1r3cQ7TMB3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppp1r3cQ7TMB3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppp1r3cQ7TMB3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppp1r3cQ7TMB3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ppp1r3cQ7TMB3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppp1r3cQ7TMB3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppp1r3cQ7TMB3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ppp1r3cQ7TMB3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppp1r3cQ7TMB3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ppp1r3cQ7TMB3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppp1r3cQ7TMB3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ppp1r3cQ7TMB3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppp1r3cQ7TMB3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppp1r3cQ7TMB3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppp1r3cQ7TMB3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppp1r3cQ7TMB3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppp1r3cQ7TMB3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppp1r3cQ7TMB3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ppp1r3cQ7TMB3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ppp1r3cQ7TMB3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ppp1r3cQ7TMB3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ppp1r3cQ7TMB3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ppp1r3cQ7TMB3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ppp1r3cQ7TMB3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ppp1r3cQ7TMB3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ppp1r3cQ7TMB3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ppp1r3cQ7TMB3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ppp1r3cQ7TMB3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ppp1r3cQ7TMB3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ppp1r3cQ7TMB3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ppp1r3cQ7TMB3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ppp1r3cQ7TMB3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ppp1r3cQ7TMB3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ppp1r3cQ7TMB3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ppp1r3cQ7TMB3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ppp1r3cQ7TMB3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ppp1r3cQ7TMB3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ppp1r3cQ7TMB3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ppp1r3cQ7TMB3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ppp1r3cQ7TMB3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ppp1r3cQ7TMB3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ppp1r3cQ7TMB3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ppp1r3cQ7TMB3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ppp1r3cQ7TMB3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ppp1r3cQ7TMB3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ppp1r3cQ7TMB3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ppp1r3cQ7TMB3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ppp1r3cQ7TMB3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms