Protein–RNA interactions for Protein: Q78J03

Msrb2, Methionine-R-sulfoxide reductase B2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msrb2Q78J03 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Msrb2Q78J03 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Msrb2Q78J03 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Msrb2Q78J03 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Msrb2Q78J03 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msrb2Q78J03 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msrb2Q78J03 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msrb2Q78J03 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Msrb2Q78J03 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msrb2Q78J03 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msrb2Q78J03 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msrb2Q78J03 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msrb2Q78J03 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msrb2Q78J03 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msrb2Q78J03 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msrb2Q78J03 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msrb2Q78J03 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msrb2Q78J03 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Msrb2Q78J03 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msrb2Q78J03 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msrb2Q78J03 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msrb2Q78J03 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Msrb2Q78J03 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msrb2Q78J03 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msrb2Q78J03 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Msrb2Q78J03 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Msrb2Q78J03 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Msrb2Q78J03 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msrb2Q78J03 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msrb2Q78J03 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Msrb2Q78J03 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msrb2Q78J03 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Msrb2Q78J03 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms