Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms