Protein–RNA interactions for Protein: Q78EE2

Gm21292, Predicted gene, 21292, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21292Q78EE2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm21292Q78EE2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm21292Q78EE2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm21292Q78EE2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21292Q78EE2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21292Q78EE2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21292Q78EE2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21292Q78EE2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21292Q78EE2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21292Q78EE2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21292Q78EE2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21292Q78EE2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21292Q78EE2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21292Q78EE2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21292Q78EE2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21292Q78EE2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21292Q78EE2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21292Q78EE2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21292Q78EE2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21292Q78EE2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21292Q78EE2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21292Q78EE2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21292Q78EE2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21292Q78EE2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21292Q78EE2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21292Q78EE2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21292Q78EE2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21292Q78EE2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21292Q78EE2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21292Q78EE2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21292Q78EE2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21292Q78EE2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21292Q78EE2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21292Q78EE2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21292Q78EE2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21292Q78EE2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21292Q78EE2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21292Q78EE2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21292Q78EE2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21292Q78EE2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21292Q78EE2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21292Q78EE2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21292Q78EE2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21292Q78EE2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21292Q78EE2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms