Protein–RNA interactions for Protein: Q76I79

Ssh1, Protein phosphatase Slingshot homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh1Q76I79 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssh1Q76I79 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssh1Q76I79 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssh1Q76I79 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssh1Q76I79 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssh1Q76I79 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssh1Q76I79 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssh1Q76I79 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssh1Q76I79 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ssh1Q76I79 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ssh1Q76I79 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ssh1Q76I79 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ssh1Q76I79 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ssh1Q76I79 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ssh1Q76I79 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ssh1Q76I79 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ssh1Q76I79 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ssh1Q76I79 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ssh1Q76I79 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssh1Q76I79 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssh1Q76I79 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssh1Q76I79 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssh1Q76I79 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssh1Q76I79 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssh1Q76I79 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssh1Q76I79 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssh1Q76I79 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssh1Q76I79 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssh1Q76I79 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssh1Q76I79 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssh1Q76I79 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssh1Q76I79 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssh1Q76I79 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssh1Q76I79 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssh1Q76I79 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssh1Q76I79 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssh1Q76I79 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssh1Q76I79 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssh1Q76I79 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssh1Q76I79 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssh1Q76I79 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssh1Q76I79 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssh1Q76I79 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssh1Q76I79 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssh1Q76I79 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssh1Q76I79 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssh1Q76I79 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssh1Q76I79 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssh1Q76I79 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssh1Q76I79 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssh1Q76I79 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssh1Q76I79 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssh1Q76I79 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssh1Q76I79 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssh1Q76I79 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssh1Q76I79 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssh1Q76I79 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssh1Q76I79 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssh1Q76I79 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssh1Q76I79 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssh1Q76I79 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssh1Q76I79 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssh1Q76I79 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssh1Q76I79 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssh1Q76I79 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssh1Q76I79 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssh1Q76I79 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssh1Q76I79 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssh1Q76I79 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ssh1Q76I79 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ssh1Q76I79 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ssh1Q76I79 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ssh1Q76I79 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ssh1Q76I79 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ssh1Q76I79 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ssh1Q76I79 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ssh1Q76I79 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ssh1Q76I79 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssh1Q76I79 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssh1Q76I79 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssh1Q76I79 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssh1Q76I79 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssh1Q76I79 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssh1Q76I79 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssh1Q76I79 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssh1Q76I79 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssh1Q76I79 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssh1Q76I79 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssh1Q76I79 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssh1Q76I79 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssh1Q76I79 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssh1Q76I79 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssh1Q76I79 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssh1Q76I79 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssh1Q76I79 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssh1Q76I79 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssh1Q76I79 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssh1Q76I79 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssh1Q76I79 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssh1Q76I79 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms