Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SynmQ70IV5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SynmQ70IV5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SynmQ70IV5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SynmQ70IV5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SynmQ70IV5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SynmQ70IV5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SynmQ70IV5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SynmQ70IV5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SynmQ70IV5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SynmQ70IV5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SynmQ70IV5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SynmQ70IV5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SynmQ70IV5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SynmQ70IV5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SynmQ70IV5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SynmQ70IV5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SynmQ70IV5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SynmQ70IV5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SynmQ70IV5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SynmQ70IV5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SynmQ70IV5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SynmQ70IV5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SynmQ70IV5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SynmQ70IV5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SynmQ70IV5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SynmQ70IV5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SynmQ70IV5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SynmQ70IV5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SynmQ70IV5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SynmQ70IV5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SynmQ70IV5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SynmQ70IV5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SynmQ70IV5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SynmQ70IV5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SynmQ70IV5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SynmQ70IV5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SynmQ70IV5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SynmQ70IV5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SynmQ70IV5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SynmQ70IV5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SynmQ70IV5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SynmQ70IV5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SynmQ70IV5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SynmQ70IV5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SynmQ70IV5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SynmQ70IV5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SynmQ70IV5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SynmQ70IV5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SynmQ70IV5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SynmQ70IV5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
SynmQ70IV5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SynmQ70IV5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SynmQ70IV5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
SynmQ70IV5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SynmQ70IV5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SynmQ70IV5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SynmQ70IV5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SynmQ70IV5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
SynmQ70IV5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SynmQ70IV5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SynmQ70IV5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SynmQ70IV5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SynmQ70IV5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SynmQ70IV5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SynmQ70IV5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SynmQ70IV5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SynmQ70IV5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SynmQ70IV5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SynmQ70IV5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SynmQ70IV5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SynmQ70IV5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SynmQ70IV5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SynmQ70IV5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SynmQ70IV5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SynmQ70IV5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SynmQ70IV5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SynmQ70IV5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SynmQ70IV5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SynmQ70IV5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SynmQ70IV5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SynmQ70IV5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SynmQ70IV5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SynmQ70IV5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SynmQ70IV5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SynmQ70IV5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SynmQ70IV5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SynmQ70IV5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SynmQ70IV5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SynmQ70IV5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SynmQ70IV5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SynmQ70IV5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SynmQ70IV5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SynmQ70IV5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SynmQ70IV5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SynmQ70IV5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SynmQ70IV5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SynmQ70IV5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SynmQ70IV5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SynmQ70IV5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms