Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWZ2

Ube2r2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2r2Q6ZWZ2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ube2r2Q6ZWZ2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms