Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RfflQ6ZQM0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RfflQ6ZQM0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms