Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQE4

Nemp1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nemp1Q6ZQE4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms