Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ino80Q6ZPV2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ino80Q6ZPV2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ino80Q6ZPV2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ino80Q6ZPV2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ino80Q6ZPV2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ino80Q6ZPV2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ino80Q6ZPV2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ino80Q6ZPV2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ino80Q6ZPV2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ino80Q6ZPV2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ino80Q6ZPV2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ino80Q6ZPV2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ino80Q6ZPV2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ino80Q6ZPV2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ino80Q6ZPV2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ino80Q6ZPV2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ino80Q6ZPV2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ino80Q6ZPV2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ino80Q6ZPV2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ino80Q6ZPV2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ino80Q6ZPV2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ino80Q6ZPV2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ino80Q6ZPV2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ino80Q6ZPV2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ino80Q6ZPV2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ino80Q6ZPV2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ino80Q6ZPV2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Ino80Q6ZPV2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ino80Q6ZPV2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ino80Q6ZPV2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ino80Q6ZPV2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ino80Q6ZPV2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ino80Q6ZPV2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ino80Q6ZPV2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ino80Q6ZPV2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ino80Q6ZPV2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ino80Q6ZPV2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ino80Q6ZPV2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ino80Q6ZPV2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ino80Q6ZPV2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ino80Q6ZPV2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ino80Q6ZPV2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ino80Q6ZPV2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Ino80Q6ZPV2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ino80Q6ZPV2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ino80Q6ZPV2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ino80Q6ZPV2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ino80Q6ZPV2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ino80Q6ZPV2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ino80Q6ZPV2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ino80Q6ZPV2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ino80Q6ZPV2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ino80Q6ZPV2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ino80Q6ZPV2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ino80Q6ZPV2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ino80Q6ZPV2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ino80Q6ZPV2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ino80Q6ZPV2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ino80Q6ZPV2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ino80Q6ZPV2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ino80Q6ZPV2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Ino80Q6ZPV2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Ino80Q6ZPV2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ino80Q6ZPV2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ino80Q6ZPV2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ino80Q6ZPV2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ino80Q6ZPV2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ino80Q6ZPV2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ino80Q6ZPV2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ino80Q6ZPV2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ino80Q6ZPV2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ino80Q6ZPV2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ino80Q6ZPV2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ino80Q6ZPV2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ino80Q6ZPV2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ino80Q6ZPV2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Ino80Q6ZPV2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ino80Q6ZPV2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ino80Q6ZPV2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ino80Q6ZPV2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ino80Q6ZPV2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ino80Q6ZPV2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ino80Q6ZPV2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ino80Q6ZPV2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ino80Q6ZPV2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ino80Q6ZPV2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ino80Q6ZPV2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ino80Q6ZPV2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ino80Q6ZPV2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ino80Q6ZPV2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ino80Q6ZPV2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Ino80Q6ZPV2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Ino80Q6ZPV2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ino80Q6ZPV2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ino80Q6ZPV2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ino80Q6ZPV2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ino80Q6ZPV2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Ino80Q6ZPV2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ino80Q6ZPV2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms